Plan Bazyliki
3. Ołtarz św. Marii Magdaleny, rokokowy, obraz z pocz. XVII w.
4. Obrazy Wojciecha Podkory (pocz. XVII w.), przedstawiające: Narodzenie Chrystusa, Ostatnią Wieczerzę, Zmartwychwstanie i Wniebowstąpienie, Zesłanie Ducha Świętego, Wniebowzięcie Matki Bożej; poniżej: Wizja bł. Stanisława Kazimierczyka i obraz św. Ubalda
5. Epitafium i portret prepozyta Marcina Kłoczyńskiego
8. Skarbiec i oratorium z XVIII-wiecznym obrazem bł. Stanisława Kazimierczyka
10. Ołtarz Najświętszego Zbawiciela;
12. Ołtarz Krzyża Świętego z grupą Ukrzyżowania, XIX w. [Widok1]
13. Ołtarz — mauzoleum św. Stanisława Kazimierczyka
14. Obrazy wotywne, przedstawiające uzdrowienia i cudy zdziałane za wstawiennictwem
15. Obraz Felix saeculum Cracoviae
16. Tablica upamiętniająca Bartłomieja Berecciego, pochowanego w tym kościele
17. Ołtarz św. Judy Tadeusza, rokokowy, z obrazem Astolfa Vagioli
19. Ołtarz Ecce Homo, z obrazem Astolfa Vagioli
20. Kaplica Matki Bożej Częstochowskiej
25. Ołtarz Miłosierdzia Bożego (dawniej św. Ubalda)
29. Kaplica św. Anny
a) Ołtarz z obrazem św. Anny Samotrzeciej i figurami
b) Szafy brackie
c) Płyta nagrobna Bartłomieja Berecciego
a) ołtarz z łaskami słynącym obrazem Matki Bożej z Jabłuszkiem
33. Nagrobek koniuszego koronnego Augustyna Kotwicza 1550 r.
35. Nagrobek Elżbiety Lexowej i jej męża Marcina Habera
A. Gotycka wieża, odbudowana 1556-58, w 2.ćw. XVII w. podwyższona i zakończona hełmem
zobacz też Przewodnik po Bazylice